Pada tahun 1997 Sekolah Menengah Agama Jengka Pusat mencatat keputusan 56.36% kelulusan dalam peperiksaan PMR. Seramai 62 orang dari 110 calon telah lulus semua matapelajaran. Keputusan PMR merosot sebanyak 2.15% berbanding tahun 1996 yang mencapai kelulusan 58.51%

Keputusan tahun 1999 menunjukkan jumlah pelajar yang lulus semua matapelajaran adalah seramai 58 orang dari 90 orang calon yang menduduki peperiksaan. Jumlah ini mewakili 64.44%. Keputusan pada tahun ini menjelaskan sedikit peningkatan dari segi peratus kelulusan dan pertambahan mutu. Walau bagaimanapun peratus pelajar lulus semua pelajaran telah merosot sebanyak 3.14%, di mana peratus pada tahun 1998 adalah sebanyak 67.58 % dan menurun menjadi 64.44% sahaja.

Keputusan tahun 2000 pula menunjukkan peningkatan yang menggalakan dari segi jumlah lulus semua matapelajaran. Peratusannya telah meningkat sebanyak 24.45 % menjadikan pencapaiannya sebanyak 80.89%. Peratusan ini mewakili 72 orang dari 89 orang calon. 

Kualiti keputusan tahun 2001 bertambah baik berbanding tahun 2000 walaupun peratusan pelajar lulus semua matapelajaran merosot kepada 74.46%. Enam matapelajaran mencatat keputusan 100% kecuali Sains 99.5%, Bahasa Arab 96.7% dan B.Inggeris 76.6%. 

Peratusan kelulusan Bahasa Arab telah meningkat sebanyak 7.9%.

Keputusan tahun 2002 memperlihatkan peningkatan yang lebih baik dari tahun sebelumnya. Semua matapelajaran mencapai kelulusan 100% kecuali Bahasa Arab dan Bahasa Inggeris. Walau bagaimanapun peratusan kelulusan kedua-dua matapelajaran tersebut telah meningkat. Bahasa Arab telah menyerlahkan kualiti yang lebih baik apabila 33 orang calonnya memperolehi pangkat A dan mereka mewakili 20% keseluruhan pelajar. Peratus pelajar yang lulus semua matapelajaran merupakan yang tertinggi sepanjang sejarah PMR iaitu sebanyak 91.82%.

Carta Kolum yang menunjukkan peratusan pelajar yang lulus

semua mata pelajaran dalam PMR sejak 1996 sehingga 2004